Le Dakar 2013 s'élancera le 5 janvier des côtes péruviennes, dans la périphérie de Lima, en direction du Chili où l'arrivée sera jugée le 20 janvier à Santiago. Les vérifications techniques seront effectuées à Magdalena et Chorrillos, discricts de la province de Lima au bord de l'océan Pacifique, du 2 au 5 janvier. Les quelque 450 motos, autos et camions passeront également par l'Argentine. Les concurrents quitteront le territoire péruvien à Tacna, ville frontalière avec le Chili, le 8 janvier, pour rejoindre San Miguel de Tucumán en Argentine.